Na de gebeurtenissen uit het vorige deel komen Miles en Gwen elkaar weer tegen sinds een lange tijd. Terwijl ze met elkaar optrekken vallen de dimensies echter weer plots uit elkaar, wat ervoor zorgt dat er nieuwe figuren tevoorschijn komen en Miles wordt gedwongen om weer een nieuw avontuur aan te gaan. Het duurt niet lang voordat Miles wordt aangevallen, waaronder door versies van zichzelf die uit de toekomst komen. Hij zal door meerdere universums moeten reizen, maar tevens zal hij ook de grote verwachtingen moeten volbrengen die zijn huidige superheldenpositie van hem vereist.